Bakterid on meie planeedil elanud juba üle miljardi aasta. Looduses ei ela nad kunagi üksi, vaid moodustavad keerukaid kooslusi, mida nimetatakse mikroelustikuks ehk mikrobiootaks. Igale piirkonnale on iseloomulik oma mikrobioota, on selleks siis metsa-, põllu- või inimese mikrobioota.